冲脉起于“肾下胞中”。为脐下肾间动气，其深伏于脊内者为“伏冲之脉”。杨上善指出：“脐下肾间动气，人之生命，是十二经脉根本，此冲脉血海，是五脏六腑十二经脉之海也，渗于诸阳，灌于诸经，故五脏六腑皆禀而有之。是则脐下动气，在于胞也……上下行者为冲脉也。”其浮见于外者，循腹上行，散于胸中，会于咽喉，络于唇口，“渗诸阳，灌诸经”。三阳中以阳明血气最盛，与冲脉关系特重，下行与少阴肾经并行而“渗三阴”。《素问·痿论》指出：“冲脉者，经脉之海也，主渗灌溪谷，与阳明合于宗筋……会于气街。”又冲脉上输于大杼，下输于上下巨虚，其联系甚为广泛。《灵枢·五音五味》指出：“血气盛则充肤热肉，血独盛则淡渗皮肤，生毫毛。”妇人因为冲任不营于中，故须不生。冲脉还概括了内分泌腺的功能。“血海有余，则常想其身大，怫然不知其所病；血海不足，亦常想其身小，狭然不知其所病。”说明了其盛衰会影响人体全身的强与弱，例如虚劳病的“腹痛里急”也是结合主治作用而言。

冲脉病的用药，李东垣主用调中益气汤，着重以当归理血，甘草缓急。叶天士又着重于“利气通络”论治，谓：“冲脉为病，络虚则胀，气阻则痛，非辛香何以入络，苦温可以通降。”如元胡、川楝、香附、郁金、降香、乌药、茺蔚子、桃仁、青皮、吴茱萸、青葱管、小茴香一类均是。《得配本草》还有木香、当归、白术、芦荟、槟榔等。吴鞠通说：“当归、茴香补冲脉。”朱小南认为入冲有吴茱萸、巴戟天、枸杞子、甘草、鹿茸、紫河车、肉苁蓉、石英、杜仲、当归、鳖甲、乌药等。其方有奔豚汤、清经汤、温海汤等，根据证候临时加减用之。