造血干细胞移植全过程包括进行移植前在门诊的准备阶段；在层流病房内接受预处理放/化疗和造血干细胞回输，造血功能重新建立阶段；转入普通病房后进行移植相关合并症的预防和治疗阶段；出院后在门诊的治疗和随访，及免疫功能恢复等阶段。其中大约需住院1～3个月不等。当然，具体住院时间的长短取决于患者的病情以及移植后有没有发生感染、出血性膀胱炎、移植物抗宿主病以及白血病复发等移植相关并发症，一般来说如果造血干细胞移植后出现并发症越多，那么住院时间就越长。